Martina Klicperová se systematicky zabývá psychologickými aspekty demokratičnosti, přechodu k demokracii a postkomunistickou totalitou. Postulovala postkomunistický syndrom a jeho symptomy. V projektu SYRI se věnuje výzkumu demokratického občanství a zdrojům demokratičnosti, jakým je politická kultura, občanský nacionalismus a slušnost. Zkoumá také důsledky pro chování v současných kontextech, zejména ve vztahu k podléhání hoaxům a populistickým svodům.