Daniela Prokschová se zabývá především výzkumem občanského vzdělávání a mediální gramotnosti na základních a středních školách. Tato témata jsou velmi aktuální v dnešní době narůstajícího populismu a výskytu dezinformací ve veřejném prostoru, který ještě akcelerovala pandemie covidu-19. Cílem občanského vzdělávání a mediální výchovy je posílení zájmu o politiku, vědomí vlastní politické efektivity a schopnost kritické analýzy mediální produkce. Výzkum Daniely Prokschové se zaměřuje zejména na střední odborná učiliště a školy v socioekonomicky znevýhodněných regionech, protože právě zde je spatřován velký potenciál ke snížení nerovností ve vzdělávání, politické participaci a zmírnění společenské polarizace.