Hlavními oblastmi výzkumného zájmu Jaroslava Bílka jsou autoritářské režimy, volební manipulace, politická represe a vztahy mezi vládou a její armádou. Všechna tato témata přirozeně souvisejí s otázkou populismu, polarizace a pandemie covid-19. Od počátku pandemie totiž sledujeme, že různé druhy politických režimů reagují na situaci odlišně.