Jan Čapek se věnuje empirické makroekonomii, zejména s využitím dynamických stochastických modelů všeobecné rovnováhy. V rámci SYRI se zabývá predikční schopností makroekonomických modelů v období krizí, např. krize covid-19, a také odhady účinnosti dopadů fiskálních opatření na ekonomický vývoj země, opět s ohledem na detailní výzkum efektů v krizových obdobích. Jan Čapek působí na Masarykově univerzitě.